分析：化学的发展史可分为三个阶段：古代化学、近代化学、现代化学，在古代对化学的认识只停留在表象阶段，到了近代，道尔顿和阿伏加德罗创立了原子论-分子学说，奠定了近代化学的基础．
解答：解：A、分子-原子论的创立是认识和分析化学现象及本质的基础，是奠定了近代化学基础的理论，故选项以正确；
B、元素周期律的发现使化学的学习和研究变得有规律可循，不是奠定近代化学基础的理论，故选项错误；
C、物质不灭定律，不是奠定近代化学基础的理论，故选项错误；
D、质量守恒定律，揭示了物质发生化学反应时的质量关系，不是奠定近代化学基础的理论，故选项错误．
故选A．
点评：本题难度不大，考查化学发展的历史，通过本题的解答有利于激发学生学习化学的兴趣，培养社会责任感．
