分析：A、根据分子的性质判断．
B、根据物质的结构情况判断．
C、根据化合物分子的结构判断．
D、根据化学变化的实质判断．
解答：解：A、分子和原子都是不断运动的，所以错误．
B、直接构成物质的粒子有三种：分子、原子、离子，所以正确．
C、化合物的分子是由不同种原子构成的，如二氧化碳分子是由碳、氧两种原子构成的，所以错误．
D、在化学变化过程中，分子破裂成原子，原子再重新组合成新的分子，反应过程中分子种类一定变，原子的种类和数目不变，所以错误．
故选B．
点评：物质的结构是化学考查热点之一，明确分子、原子、离子的概念，原子内部各种粒子间的质量、电荷、数目关系，是解题的基本要求．
