C
分析:分子、原子都是构成物质的粒子,它们的质量都很小,分子在化学变化中可以分成原子,而原子不能再分;据此进行分析判断.
解答:分子、原子都是构成物质的粒子,在化学变化中,分子变为原子,原子再重新结合,故它们的根本区别是在化学变化中,分子可分,原子不可分.
A、分子与原子的根本区别是在化学变化中,分子可分,原子不可分;而不是否能直接构成物质,故选项错误.
B、分子与原子的根本区别是在化学变化中,分子可分,原子不可分;而不是否能保持物质的化学性质,故选项错误.
C、分子与原子的根本区别是在化学变化中,分子可分,原子不可分,即是否在化学反应中发生种类的变化,故选项正确.
D、分子与原子的根本区别是在化学变化中,分子可分,原子不可分;而不是否能构成单质,故选项错误.
故选C.
点评:本题难度不大,主要考查了分子和原子的本质区别,抓住它们的本质区别即可正确解答本题.