B 分析：生物进化的证据有化石证据、比较解剖学上的证据、胚胎学上的证据等，化石是指保存在岩层中地质历史时期的古生物遗物和生活遗迹． 解答：化石是保存在岩层中的古生物遗物和生活遗迹．直接说明了古生物的结构或生活习性．因此化石是研究生物进化最重要的、最直接的证据．化石在地层中出现的先后顺序，说明了生物是由简单到复杂、由低等到高等、由水生到陆生逐渐进化而来的，始祖鸟化石说明了鸟类是由古代的爬行动物进化来的等．故研究生物进化的最主要的证据是化石． 故选：B． 点评：理解化石的形成和分布规律是解答的关键．
