解：（1）男的性染色体为XY，女的性染色体为XX．4的性染色体组成为XY，其X染色体一定来自2母亲，Y一定来自1父亲．
（2）生物的变异是指生物亲代与子代以及子代个体之间存在的差异，如果成员5和6生来就是双眼皮，而成员9却是单眼皮，体现了亲、子代之间的性状差异，因此这种现象在遗传学称为变异．在一对相对性状的遗传过程中，子代个体出现了亲代没有的性状，则亲代个体表现的性状是显性性状，基因组成是杂合的，新出现的性状一定是隐性性状，由一对隐性基因控制．因此如果成员5和6生来就是双眼皮，而成员9却是单眼皮，表明单眼皮是隐性的，单眼皮孩子9的基因组成是tt．
（3）若图1中5为单眼皮，6为双眼皮，生了一个单眼皮的孩子9，则单眼皮的孩子9的基因组成是tt，一定有一个t来自父亲，而父亲6是双眼皮，因此父亲的基因组成是Tt．染色体、基因在体细胞中成对，在生殖细胞中成单．成对的基因位于成对的染色体上，且在染色体上的位置相同．因此父亲体细胞内基因与染色体的关系如图：
．
故答案为：
（1）2
（2）变异； tt
（3）Tt； 父亲体细胞内基因与染色体的关系图（画错无分）
分析：生物体的某些性状是由一对基因控制的，而成对的基因往往有显性显性和隐性之分，当细胞内控制某种性状的一对基因，一个是显性、一个是隐性时，只有显性基因控制的性状才会表现出来．儿子X染色体一定来自于母亲，Y一定来自父亲，女儿的X染色体可能来自母亲，也可能来自父亲．
点评：解答此类题目点关键是理解性别的遗传和基因的显性与隐性．
