解:(1)大豆种子由③种皮和胚组成,种皮具有保护作用,胚由④胚芽(发育成茎和叶)、①胚轴(发育成连接茎和根的部分)、②胚根(发育成根)、⑤子叶(转运营养物质)四个部分组成.
(2)胚是种子的主要部分,因为其中④胚芽发育成茎和叶、①胚轴发育成连接茎和根的部分、②胚根发育成根、⑤子叶转运营养物质或储存营养物质作用,所以是新植物体的幼体.
(3)大豆种子包括种皮和胚两部分,种皮质地坚硬,具有保护作用,胚包括胚根、胚轴、胚芽和子叶,营养物质储存在子叶中.
(4)菜豆是被子植物,它与裸子植物的根本区别在于种子外面有果皮包被.
故答案为:(1)③种皮 (2)④胚芽 (3)①②④⑤(4)果皮
分析:本题考查种子的结构和成分的有关知识,据此答题.
点评:种子一般包括种皮(有保护作用)、胚乳(部分种子含有用于储存营养物质)和胚(包括胚根、胚芽、胚轴、子叶).种子的营养物质储存在胚乳或子叶中.