C
分析：生物进化论，是生物学最基本的理论之一，是指生物在变异、遗传与自然选择作用下的演变发展、物种淘汰和物种产生过程；地球上原来无生命，大约在30多亿年前，在一定的条件下，形成了原始生命，其后，生物不断的进化，直至今天世界上存在着170多万个物种；生物进化论最早是由达尔文提出的，其在著《物种起源》时有详细的论述．
解答：A：化石是研究生物进化最重要的、比较全面的证据，不同的地层中埋藏着不同类型的生物化石．故不符合题意．
B：生物界普遍存在变异，古代的长颈鹿存在着颈长和颈短、前肢长和前肢短的变异，这些变异是可以遗传的，前肢和颈长的能够吃到高处的树叶，就容易生存下去，并且繁殖后代；前肢和颈短的个体，吃不到高处的树叶，当环境改变食物缺少时，就会因吃不到足够的树叶而导致营养不良，体质虚弱，本身活下来的可能性很小，留下后代的就会更小，经过许多代以后，前肢和颈短的长颈鹿就被淘汰了，这样，长颈鹿一代代的进化下去，就成了今天我们看到的长颈鹿．因此长颈鹿的长颈和高前肢的形成就是长期自然选择的结果．
C：1860年，在德国巴伐利亚省的石灰岩层中，发现了第一个始祖鸟化石．始祖鸟的身体大小如乌鸦，它保留了爬行类的许多特征，例如嘴里有牙齿，而不是形成现代鸟类那样的角质喙；指端有爪等；但是另一方面，始祖鸟又具有鸟类的一些特征，如已经具有羽毛，在一些骨骼形态上也表现出一些鸟类特征或过渡特征，如它的第三掌骨已经与腕骨愈合，总之，它的身体结构既和爬行动物有相似之处，又和鸟类有相同之处，根据以上特征，科学家认为始祖鸟是由爬行类进化到鸟类的一个过渡类型．
D：化学起源学说认为：地球从形成到现在大约有46亿年的历史．早期的地球是炽热的球体，地球上的一切元素都呈气体状态，那时谈不到生命的发生．后来随着地球的慢慢冷却，才逐渐为生命的发生提供了一定的条件，原始大气的主要成分是氨、氢、甲烷、水蒸气．水是原始大气的主要成分，当时由于大气中没有氧气，因而高空中也没有臭氧层阻挡，不能吸收太阳辐射的紫外线，所以紫外线能直射到地球表面，在紫外线、天空放电、火山爆发所放出的能量、宇宙间的宇宙射线，以及陨星穿过大气层时所引起的冲击波等这些能量作用下空气中的无机物经过复杂的化学变化转化形成了一些有机小分子物质物，后来随着地球的慢慢冷却，于是随倾盆大雨从天而降，汇集入原始海洋． 在原始海洋中，经过上万年后这些有机小分子长期累积并相互作用，形成了比较复杂的有机大分子物质，如原始的蛋白质、核酸等．这些物质并逐渐形成了与海水分离的原始界膜，构成了相对独立的体系．一旦这些物质拥有了个体增殖和新陈代谢也就意味产生了生命．所以原始海洋是生命诞生的摇篮．
故选C
点评：灵活运用所学知识解释实际问题是解答此类题目的关键．
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