解:(1)BE=CF,
理由:∵四边形ABGF和四边形ACDE是正方形,
∴AF=AB,AC=AE,
∵∠BAF=∠CAE=90°,
∴∠BAF+∠BAC=∠CAE+∠BAC即∠FAC=∠BAE,
∵在△FAC和△BAE中,


∴△FAC≌△BAE(SAS),
∴BE=CF;
(2)△FAC和△BAE可以通过旋转而相互得到,旋转中心是点A,旋转角是90°;
(3)结论仍然成立,
理由:如图2,∵四边形ABGF和四边形ACDE是正方形,
∴AF=AB,AC=AE,
∵∠BAF=∠CAE=90°,
∴∠BAF+∠FAE=∠CAE+∠FAE即∠FAC=∠BAE,
∵在△FAC和△BAE中,

∴△FAC≌△BAE(SAS),
∴BE=CF.
分析:(1)利用正方形的性质得出∠FAC=∠BAE,AF=AB,AC=AE,即可得出△FAC≌△BAE进而得出BE=CF;
(2)根据旋转前后图形的关系得出旋转中心和旋转角的度数即可;
(3)利用正方形的性质得出∠FAC=∠BAE,AF=AB,AC=AE,即可得出△FAC≌△BAE进而得出BE=CF.
点评:此题主要考查了旋转的性质以及全等三角形的判定与性质和正方形的性质等知识,根据已知得出∠FAC=∠BAE是解题关键.