解:(1)由题意得:OC=4,OD=2,∴DM=OC+OD=6。
∴顶点M坐标为(2,6)。
设抛物线解析式为:y=a(x﹣2)
2+6,
∵点C(0,4)在抛物线上,∴4=4a+6,解得a=

。
∴抛物线的解析式为:y=

(x﹣2)
2+6=

x
2+2x+4。
(2)如答图1,过点P作PE⊥x轴于点E.

∵P(x,y),且点P在第一象限,∴PE=y,OE=x。
∴DE=OE﹣OD=x﹣2.
∴S=S
梯形PEOC﹣S
△COD﹣S
△PDE=

(4+y)•x﹣

×2×4﹣

(x﹣2)•y=y+2x﹣4。
将y=

x
2+2x+4代入上式得:S=

x
2+2x+4+2x﹣4=

x
2+4x。
在抛物线解析式y=

x
2+2x+4中,令y=0,即

x
2+2x+4=0,解得x=2±

.
设抛物线与x轴交于点A、B,则B(2+

,0)。
∴0<x<2+

.
∴S关于x的函数关系式为:S=

x
2+4x(0<x<2+

)。
(3)存在。若以O、P、E为顶点的三角形与△OPD全等,可能有以下情形:
①OD=OP。
由图象可知,OP最小值为4,即OP≠OD,故此种情形不存在。
②OD=OE。
若点E在y轴正半轴上,如答图2所示,此时△OPD≌△OPE。

∴∠OPD=∠OPE,即点P在第一象限的角平分线上。
∴直线PE的解析式为:y=x。
若点E在y轴负半轴上,易知此种情形下,两个三角形不可能全等,故不存在。
③OD=PE。
∵OD=2,∴第一象限内对称轴右侧的点到y轴的距离均大于2。
∴点P只能位于对称轴左侧或与顶点M重合。
若点P位于第一象限内抛物线对称轴的左侧,易知△OPE为钝角三角形,而△OPD为锐角三角形,则不可能全等。
若点P与点M重合,如答图3所示,此时△OPD≌OPE,四边形PDOE为矩形。

∴直线PE的解析式为:y=6。
综上所述,存在以O、P、E为顶点的三角形与△OPD全等,直线PE的解析式为y=x或y=6。