解:(1)∵抛物线y=ax
2-2ax+c(a≠0)与y轴交于点C(O,4),与x轴交于点A、B,点A的坐标为(4,0)
∴

解得:

∴函数关系式为

;
(2)设Q(m,0),
可求得B(-2,0),|BA|=6,|BQ|=m+2,
因QE∥AC,∴△BQE∽△BAC,∴

,
∴

.

,
当m=1时,面积最大,此时Q(1,0);
(3)由对称性和垂径定理知,圆心必在抛物线对称轴上,
抛物线对称轴为x=1.当圆心在x轴上方时,设圆心坐标为(1,r),(r>0).
则M(1-r,r),将M点的坐标代入抛物线解析式中得:

,
解得

.当圆心在x轴下方时,可求得

,
所以当MN所在的直线解析式为

时,
以线段MN为直径的圆与x轴相切;
(4)若△APQ∽△ACB时,t=2.4;
若△APQ∽△ABC时,t=

.
分析:(1)根据抛物线y=ax
2-2ax+c(a≠0)与y轴交于点C(O,4),与x轴交于点A(4,0),将经过的两点的坐标代入到二次函数中即可求得二次函数的解析式;
(2)设Q(m,0),可求得B(-2,0),|BA|=6,|BQ|=m+2,根据QE∥AC得到△BQE∽△BAC,利用相似三角形面积的比等于相似比的平方表示出三角形BEQ的面积,进而表示出三角形CQE的面积,求出最大值即可;
(3)由对称性和垂径定理知,圆心必在抛物线对称轴上,抛物线对称轴为x=1.然后分当圆心在x轴上方时和当圆心在x轴下方时,两种情况求得r的值即可;
(4)分△APQ∽△ACB和△APQ∽△ABC两种情况求得t的值.
点评:本题考查了二次函数的综合知识,这类题目往往出现在中考试题的最后一个题中,难度相对较大.