D
分析：首先利用不等式的基本性质解不等式，再从不等式的解集中找出适合条件的自然数即可．
解答：由不等式2x-6≤0的两边同时加上6，得
2x≤6，
不等式的两边同时除以2，得
x≤3；
∴等式2x-6≤0的自然数解是：0、1、2、3共有4个；
故选D．
点评：本题考查了一元一次不等式的整数解．解答此题要先求出不等式的解集，再确定非负整数解．解不等式要用到不等式的性质：（1）不等式的两边加（或减）同一个数（或式子），不等号的方向不变；（2）不等式两边乘（或除以）同一个正数，不等号的方向不变；（3）不等式的两边乘（或除以）同一个负数，不等号的方向改变．
