解:(1)∵抛物线y=-x
2-(m-1)x+m
2-6与y轴交于点B(0,3),
∴m
2-6=3.
∴m=±3.
∵抛物线的顶点在第二象限,
∴m=3.
∴抛物线的解析式为y=-x
2-2x+3.
(2)猜想:CD⊥AC,如图(1):

证明如下:
∵A(-3,0),B(0,3),C(-1,4),
∴AB=3

,AC=2

,BC=

.
∴AB
2+BC
2=AC
2,
∴∠ABC=90°,
∴∠CAB+∠ACB=90°,
又∵∠CAB=∠DCB,
∴∠DCB+∠ACB=90°,
∴CD⊥AC.
(3)设直线AC的解析式为y=kx+b,
将A(-3,0),C(-1,4)代入可得:

,
解得:

,
即直线AC的解析式为y=2x+6.
过B作BK∥x轴,交AC于点K,
则点K的坐标为(-

,3),
①当0<t<

时,如图(2),EF交AB于点Q,GF交AC于点N,过N做MP∥FE交x轴于P点,交BF的延长线点M,

由△AGN∽△KFN,得

,
即

,
解得PN=2t,
则S
阴影=S
△FGE-S
△QAE-S
△AGN=

=-

t
2+3t.
②当

≤t≤3时,如图(3),EF交AB于点N,交AC于点M,BF交AC于点P,

.
由△AME∽△PMF,
得

.
即

,
解得ME=2(3-t),
∴S

(3-t)×

.
综上所述:S=

.
分析:(1)将点B的坐标代入可得出m的值,继而得出抛物线的解析式;
(2)分别求出点A、B、C的坐标,根据勾股定理的逆定理可判断出∠ABC=90°,继而利用等量代换可得出∠DCB+∠ACB=90°,继而得出结论.
(3)过点B作BF∥x轴,交AC于点K,求出点K的坐标,然后根据K的横坐标,可分类讨论,①当0<t<

时,②当

≤t≤3时,分别表示出阴影部分的面积即可.
点评:本题属于二次函数的综合题,涉及了待定系数法求函数解析式、勾股定理的逆定理及分段函数的知识,综合考察的知识点较多,对于此类综合题目,往往前两问都比较简单,同学们不要碰到这样的综合题就退缩.