C
分析:根据题意即可推出BH=CH,∠BAH=∠CAH,∠ABC=∠ACB,推出△ABH≌△ACH,△BCE≌△CBD,即可推出BE=CD,AE=AD,推出△ABD≌△AEC,△AEO≌△ADO,△EOB≌△DOC,△OHB≌△OHC,共5对全等直角三角形.
解答:∵AB=AC,AC≠BC,AH⊥BC于H,BD⊥AC于D,CE⊥AB于E,
∴BH=CH,∠BAH=∠CAH,∠ABC=∠ACB,BC=CB,AH=AH,
∴Rt△ABH≌Rt△ACH,Rt△BCE≌Rt△CBD,
∴BE=CD,
∴AE=AD,
∴Rt△AEO≌Rt△ADO,Rt△EOB≌Rt△DOC,Rt△ABD≌Rt△AEC,
∴OB=OC,
∴Rt△OHB≌Rt△OHC.
∴共有5对全等直角三角形.
故选C.
点评:本题主要考查全等三角形的判定和性质,直角三角形的判定,关键在于根据已知推出相等关系,熟练运用直角三角形全等的判定定理.